Super Monkey Ball 3D será uno de los juegos que acompañe al lanzamiento de la nueva Nintendo 3DS en todo el mundo, y utilizará varias de sus peculiares características.
Además de los visuales en 3D en la pantalla superior de la consola y el control con el movimiento gracias a los giroscopios, tendrá compatibilidad con el podómetro integrado.
Nintendo 3DS premiará con monedas virtuales a los usuarios que caminen con ella, y esas monedas podrán ser canjeadas por personajes y contenidos extra en Super Monkey Ball 3D.