Uno de los mayores inconvenientes de Metal Gear Solid 3: Snake Eater fue su modo de cámara, rectificado en la posterior versión Subsistance.
La nueva edición del juego, Snake Eater 3D para Nintendo 3DS, contará con mejoras con respecto al original, avances que ya se produjeron en posteriores entregas de la saga como Metal Gear Solid 4 y MGS: Peace Walker.
El productor del juego asegura que han sido introducidas mejoras en el control, así como un sistema de cámara libre, híbrido entre la de Subsistance y la de MGS4 y Peace Walker.